• الصيدلية المركزية :

• وتقع شمال شرق المجمع بجوار المغسلة وهى عبارة عن عدة أقسام:

• قسم المخدرات: ويقوم بتزويد الأدوية المحظورة إلى أقسام المجمع المختلفة ومراقبة صرفها حسب النظام.

• قسم الأدوية: يقوم بتزويد الأدوية للصيدليات الفرعية في المستشفيات الثلاثة .

• قسم المحاليل الوريدية والمطهرات : ويقوم بصرف هذه الأصناف إلى جميع أقسام المجمع.

• قسم المهمات الطبية المستهلكة : ويقوم بصرفها للصيدليات الفرعية وللأقسام .

• صيدلية الباطنة : مقرها مستشفى الباطنة الدور الأول وتقوم بصرف الأدوية للمرضى المنومين في مستشفى الباطنة.

• صيدلية الجراحة : مقرها مستشفى الجراحة الدور الثاني وتقوم بصرف الأدوية للمرضى المنومين في مستشفى الجراحة

• صيدلية العمليات : ومقرها داخل قسم العمليات الكبرى في مستشفي الجراحة و تقوم بصرف المهمات الطبية المستهلكة و بعض أصناف الأدوية اللازمة للعمليات .

• صيدلية الأشعة : مقرها داخل قسم الأشعة في مستشفي الجراحة و تقوم بصرف الصنفات و الأفلام لقسم الأشعة

• صيدلية الولادة : مقرها مستشفي الولادة الدور الثاني وتقوم بصرف الأدوية لأقسام الولادة .

• الصيدلية الخارجية : تقوم بصرف وصفات طبية للمرضي الخارجين ( مرضي الكلي ، مرضي الأورام والدم ) وكذلك لموظفي المجمع ، كما أنها تقوم بجمع تقارير أدوية السلفة و عرضها علي لجنة الأدوية التخصصية بالإدارة العامة للصيدلة وكذلك العمل علي توفيرها عندما تتم الموافقة عليها .

• صيدلية العلاج الكيميائي :

• تقوم بتحضير العلاج الكيماوي لمرضي الأورام بناءا علي وصفة الأخصائي .